Un día llega al instituto Kazami Yuuji, el primer estudiante masculino de la academia, y en Mihama se pierde completamente el equilibrio. ¿Es Yuuji lo que las chicas necesitan para poder recuperar sus vidas o acaso el peso de sus pasados será un muro demasiado grande como para superarlo? ¿Y si es el pasado de Yuuji el más duro de todos?

Durante sus viajes, aparecían chicas parecidas a Chaika, cada una diciendo ser ella. Una vestida de rojo, una en azul, otra en blanco… Pero todas las “Chaika” compartían el mismo objetivo de buscar los restos del emperador. ¿Cuál será la verdadera? ¿Qué es exactamente “Chaika”? Muchos misterios entrelazados en una red compleja, todos centrándose en “Chaika” y los restos. ¿Qué verdad será revelada cuando todos los restos se hayan recopilado?